MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 4561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	A	6	6	2	7	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017361	TTC	2	6	2458	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017361	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017361	TAT	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017361	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017361	TGG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017361	GTG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017361	ACC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017361	GGT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017361	T	8	8	4604	4611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017361	TAG	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017361	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017361	AAAC	2	8	4743	4750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017361	TTG	2	6	4758	4763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017361	TTG	2	6	4768	4773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017361	A	6	6	4787	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017361	GTTTT	2	10	4793	4802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017361	TTA	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017361	T	6	6	4830	4835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017361	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017361	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017361	GATTT	2	10	4888	4897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017361	T	7	7	4912	4918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017361	A	6	6	4939	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017361	G	6	6	4963	4968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017361	T	6	6	5013	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017361	T	7	7	5046	5052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017361	TTG	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017361	A	6	6	5065	5070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017361	TTTGT	2	10	5113	5122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017361	AAAAAG	2	12	5166	5177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017361	C	6	6	5184	5189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_017361	AG	3	6	5194	5199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017361	A	9	9	5205	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017361	A	6	6	5220	5225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017361	C	6	6	5230	5235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_017361	AAAG	2	8	5238	5245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017361	A	6	6	5264	5269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017361	A	6	6	7319	7324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017361	GA	7	14	7358	7371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017361	AGT	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017361	T	7	7	7382	7388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017361	AAATT	2	10	7406	7415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017361	T	12	12	7473	7484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017361	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017361	TTTG	2	8	7527	7534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017361	GGT	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017361	T	6	6	7608	7613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017361	AGCG	2	8	7630	7637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017361	TAA	3	9	9411	9419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017361	ATAA	2	8	9802	9809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017361	TTA	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017361	ATTATA	2	12	9896	9907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017361	ATT	2	6	9911	9916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017361	A	6	6	9964	9969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017361	G	6	6	9970	9975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017361	CAA	2	6	9982	9987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017361	TATT	2	8	10004	10011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017361	A	6	6	10042	10047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017361	AAAG	2	8	10056	10063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017361	A	6	6	12848	12853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017361	AGG	2	6	12881	12886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017361	T	6	6	13726	13731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017361	GCTTT	2	10	13739	13748	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017361	T	6	6	13746	13751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017361	ACC	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017361	T	7	7	13808	13814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017361	TTAA	2	8	13837	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017361	GTTT	2	8	16784	16791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017361	CA	3	6	16825	16830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017361	CTG	2	6	16846	16851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017361	A	6	6	16980	16985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017361	TTCT	2	8	17015	17022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017361	TTAA	2	8	20694	20701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017361	ATCA	2	8	22900	22907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017361	TTG	2	6	22987	22992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017361	TCA	2	6	23000	23005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017361	TTA	2	6	23049	23054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017361	GAAAA	2	10	23056	23065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017361	TAT	2	6	23088	23093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017361	ATT	2	6	23096	23101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017361	AGG	2	6	23277	23282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017361	CAT	2	6	23285	23290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017361	CAG	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017361	T	6	6	23361	23366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017361	A	6	6	23402	23407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017361	A	6	6	23412	23417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017361	A	6	6	23466	23471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017361	A	6	6	23475	23480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017361	A	6	6	23484	23489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017361	GATTT	2	10	23523	23532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017361	TGT	2	6	23533	23538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017361	G	6	6	23598	23603	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017361	AAG	2	6	23650	23655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017361	TAAC	2	8	23678	23685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017361	T	7	7	23691	23697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017361	TTG	2	6	23699	23704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017361	A	6	6	23710	23715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017361	T	6	6	23728	23733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017361	TTTGT	2	10	23759	23768	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017361	A	6	6	23769	23774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017361	A	6	6	23809	23814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017361	A	6	6	23827	23832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017361	AGA	3	9	23842	23850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017361	C	6	6	23855	23860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_017361	A	6	6	23861	23866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017361	A	6	6	23892	23897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017361	TCA	2	6	23903	23908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017361	A	7	7	23916	23922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017361	A	16	16	26315	26330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017361	TGT	2	6	26339	26344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017361	AG	3	6	26401	26406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017361	G	9	9	26420	26428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017361	ATTTT	2	10	26432	26441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017361	T	6	6	26451	26456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017361	AAG	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017361	T	6	6	26536	26541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017361	TTA	2	6	26577	26582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017361	TTA	2	6	27948	27953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017361	A	6	6	27960	27965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017361	T	6	6	27995	28000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017361	A	6	6	28038	28043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017361	TAT	2	6	32392	32397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017361	TGC	2	6	41078	41083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017361	TAA	2	6	41097	41102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017361	AG	3	6	41116	41121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017361	TATGA	2	10	44699	44708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017361	GGTTT	2	10	44745	44754	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017361	ATTGT	2	10	44947	44956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017361	TTG	2	6	45482	45487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017361	AGTG	2	8	45503	45510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017361	TAG	2	6	45511	45516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017361	ACTTAG	2	12	45517	45528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017361	TAA	2	6	49849	49854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017361	GCAA	2	8	49864	49871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017361	TAA	2	6	51686	51691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017361	A	6	6	51697	51702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017361	T	6	6	52903	52908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017361	TCA	2	6	52968	52973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017361	T	6	6	54591	54596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017361	T	7	7	58171	58177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017361	AGCG	2	8	58208	58215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017361	T	6	6	58242	58247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017361	TAAT	2	8	58271	58278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017361	T	6	6	58295	58300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017361	TAT	2	6	58339	58344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017361	TAT	2	6	58366	58371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017361	TAT	2	6	58405	58410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017361	AAAT	2	8	58437	58444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017361	A	6	6	58511	58516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017361	T	6	6	58778	58783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017361	TGT	2	6	58856	58861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017361	GCTTG	2	10	58882	58891	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_017361	ATA	2	6	58901	58906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017361	AAT	2	6	84468	84473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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